Bu projenin devreye girmesiyle Siirt, Şırnak, Mardin, Batman ve Diyarbakır'da toplamda 199 yerleşim alanı sular altında bırakıldı. Baraj havzasında geçtiğimiz ekim ayında suların kontrollü çekilmesi nedeniyle, binlerce balık öldü. Şu sıralar barajdaki su seviyesi, yeniden yükselirken bu defa da kirlilik ortaya çıktı. Bu yıl, neredeyse petrol rengini andıran barajda balık ölümleri yine başladı. Yavru balıkların yanı sıra, özellikle Dicle Nehri'nde yaşayan balık türlerinden olan yayın balıklarının baraj havzasında ölmesi bölge insanlarını rahatsız etti. Barajın Hasankeyf mevkiinde görülmeye başlanan balıkların ölüm nedeni ile ilgili yetkili birimlerin inceleme yapmasını isteyen yöredeki çobanlardan Eyüp Ağalday, ANKA Haber Ajansı’na şunları söyledi: “Barajda gözle görülür bir kirlilik var. Geçen yıl yüzbinlerce balık, su çekildiği için ölmüştü. Bu sene sular yükselirken balıklar ölüyor. Geçen yıldan farklı olarak, bu yıl yayın balıkları da ölmeye başladı. Sıcaklıktan mı, oksijensizlikten mi, yoksa bir atık mı? Biz bilemiyoruz. Yetkililerin gelip bu durumu incelemesini istiyoruz. Eski Hasankeyf yerleşkesi ile yeni yerleşkenin kıyılarında her on metrede ölü balıklarla karşılaşıyoruz. Her yıl bu olmak zorunda mı? Özellikle de balıkların yavrulama döneminde olması, insanı şüphelendiriyor. Baraj suyunu kullanan çobanlar var. Aynı sudan keçi ve koyunlar da içiyor. Baraj sahasının kıyı kenarlarına domuz, tilki gibi yabani hayvanlar gelerek su içiyor. Bu balıkları aç olan hayvanlar yerse onlar da zehirlenip ölebilir. Bunu nedeninin bir an önce araştırılmasını istiyoruz.”